夜深人静，林白敲开了自家的大门，母亲开门后，却见林白脸色苍白，目光呆滞地走进房间，母亲关心儿子，随即跟进房间查看，却发现儿子无影无踪。林父准备报案却在门前马车上发现了儿子的尸体，赶紧向大理寺报案。
双叶经过验尸，知道林白死亡时间不超过十二个时辰，调查组来到林白家里，却发现死者的房间是一个典型的密室，不知死者是如何被人杀害的。萨摩多罗参加贺源组织的聚会，在会上，贺源声称自己藏有价值连城的真经。四娘据此忆起曾押镖时遇到假扮游僧的匪帮之事，十几个兄弟惨死让四娘记恨在心，李郅声称会帮四娘查明真相。
李郅找到贺源，询问他的经书从何而来，贺源声称自己只是捡了一本经书，那天不过是在吹牛罢了。张继龙木匠发了一笔小财，他急于离开长安，将店铺卖给了天竺游僧，游僧花了大价钱买下了张继龙的店铺。
第二天，大理寺正在为案件毫无进展而担忧，此时李郅又接到薛义溺毙的报案，薛义与林白的死法一致。据薛义妻子称，她亲眼看见丈夫回家，只是身上湿透了，不知怎么就突然消失并且尸体坐在马车里回来了。这一切都如此骇人听闻，大理寺也毫无办法。
萨摩多罗在集市上观摩天竺商人变戏法，天竺商人给大家上演了一出大变活人的戏法，一下子启发了萨摩多罗，令他想通了案件的离奇之处。
贺源又不改吹牛的毛病，他在聚会上开始以鬼魂之说蛊惑人心，弄得人心惶惶，这时，调查组和官兵来到现场，贺源见了，赶紧闭口不言，装作在讲解经书。大理寺以造谣生事、煽动恐慌为由逮捕了贺源。贺源上个月曾经举办集会，而两个死者都参加了。调查组让贺源再假意宣传，死者是得知了通往西域的寻宝路线图才遇到不测的，要以此引蛇出洞。
果然，真凶按捺不住，开始有所行动，却中了早有准备的埋伏，其主谋就是张继龙，而他的五名学徒也是同谋。张继龙学习过易容术，他先是假扮成死者的模样回到家中，关上房间门时，再把隐藏的门栓弹出，于是，在家人开门进屋的时候，他也随着转门转到了室外，出门后，他又把门栓换回了正常的模式，整个事件就是这样，如此精巧设计，只有技术很高的木工才能做到。而贺源举办集会时，林薛两家都在参加集会，他正好有机会潜入别人家里，在门上做手脚。
两个死者都曾经在凉州经商，他们在长安加入了一个商会，商会内部知道一个去凉州的近路，可以节省很多时间和费用，但这条近路要翻过长安西南的一座无名山，阻碍了凶手团伙在山上的秘密行动，所以被杀了，而这个秘密活动，正是有敌军潜入窥探长安。案件水落石出，可是张继龙与五位学徒皆咬舌自尽。
月色迷离，四名书生夜闯北城古楼，刚开始他们还谈笑风生，结果进入古楼后，听到了女人凄惨空灵的哭声，并有人头在不停跳动，几个书生顿时被吓得仓皇失措，落荒而逃。
闹鬼案的调查落在紫苏身上，这件事事关能否在北城修建行宫，父亲嘱咐紫苏，有鬼抓鬼，装鬼抓人，一定要将此事查的水落石出。凡舍里，一位公子吹奏乐曲，动听如同天籁，招徕了许多顾客，四娘心生感激。萨摩多罗见状不服气，也想学着吹笛子。紫苏来到凡舍请萨摩多罗帮忙，两人前去古楼查探也听到了嚎哭声。
调查组深入调查后，得知被吓书生的父亲是个捕头，曾经有女子晓芸被木商张家儿子张天霸强行夺走清白，晓芸羞愤不已跳楼自尽，但捕头迟迟没能将张天霸抓捕归案，自此古楼开始闹鬼。
大家又来到林晓芸家里，晓芸的父母老泪纵横，十分痛心，好不容易替女儿找回公道，可张天霸却消失得无影无踪，老两口深感对不住女儿。大家经过晓芸父母同意，挖出了晓芸的棺材，查验后发现晓芸的头还在，证明古楼里跳动的人头不是晓芸的，种种迹象表明有人在背后捣鬼。
张天霸的父亲为了给儿子赎罪，经常去古楼供奉晓芸，但他却说从未见过跳动的头，也不见有人吃过供品。
双叶意外找到了张天霸的尸体，晓芸父亲主动自首，称自己被女儿亡魂附身杀了张天霸。李郅不相信附身一说，决定重新审理此案。萨摩多罗发现尸体上布满刀疤，他据此推断出了案件的真相。
原来，张天霸并没有死，死的是林捕头，尸体身上的刀疤说明，死者是习武之人，并不是养尊处优的张天霸。木商砍断儿子的手，杀害肢解林捕头后，做出张天霸已死的假象，再用迷香迷晕晓芸父亲，给他造成附身的假象，嫁祸于他。而这么长时间，张天霸一直就躲在古楼里，木商每天送去的祭奠晓芸的饭菜，就是给自己儿子吃的。而木商杀死林捕头的动机，正是因为林捕头知晓木商的秘密。而古楼里的鬼哭声是木窗发出的，跳动的人头也是木商用木制青蛙做的。一切证据就在古楼地下，那也正是张天霸藏身的地方。
事已至此，木商和张天霸再也无法抵赖，只好伏法。
皇家夜宴上，突厥王子阿史那都向吴王进献千年太岁，本以为是吉祥植物，可谁料千年太岁却杀死了吴王的侧室张夫人。双叶给张夫人验尸，发现她是被打晕后，被上千条水蛭撕咬失血过多而亡。据吴王所说，宴会开始前，自己喝了一点酒，由下属蔺飞白看着时间，小憩了一会儿。
李郅疑心吴王妃争风吃醋谋害死者，岂料吴王妃在私会突厥王子后失踪。客栈小二称，阿史那都和吴王妃昨晚发生争执，两人好像曾经是情侣关系，争吵后王妃独自离开了。调查组逮捕了阿史那都，他激烈挣扎，大喊着自己没有杀人。他坦然承认自己和王妃早就私定终身，但却没有做伤天害理的事情，只是想带走曾经的恋人。
萨摩多罗发现蔺飞白身上带着一个香囊，里面的香料很容易招虫子。突厥王子成为嫌犯关入大牢，突厥随即调遣大军逼迫大唐交出王子。这个案子如果再不破，就很有可能导致两国交战，大理寺现在压力颇大。
阿史那都供词，在长安郊区有一处木屋，在这里与王妃约会。紫苏和黄三炮来到木屋，发现吴王妃意外惨死在这里。她死前曾被绑在椅子上，头部被钝物击打，肺部被一种异域兵器所伤，是致命伤。李郅和多罗猜出凶手身份，却无法看破杀人动机和杀人手法。萨摩多罗灵机一闪，猜到了凶手的动机和他接下来要谋害的人。
没错，凶手的下一个目标就是阿史那都，他在谋杀突厥王子时当场被捕，他就是蔺飞白，是一个会操纵虫豸的伽罗师，他培育了很多水蛭，谋害别人性命。
蔺飞白先告诉张夫人，食用太岁可以永葆青春，便约张夫人去偷盗太岁。在当晚夜宴开始之前，蔺飞白给王爷的酒里下了药，王爷以为自己小憩了一刻钟，实际却是很长时间，足够让蔺飞白在约定好的地方杀死张夫人。之后，吴王妃发觉了这个秘密，蔺飞白本来没有想杀害她，可吴王妃奋力抵抗，要去告发这个惊天阴谋，蔺飞白不得已将其杀人灭口。他的动机就是栽赃嫁祸给突厥王子，引起大唐和突厥的纷争。因为他是伽蓝国的人，不是大唐人。
在罪证被揭穿后，蔺飞白直视着萨摩多罗，口口声声问他，同样为伽蓝人，难道不想重建伽蓝国吗？而萨摩多罗不愿再起纷飞战火，让百姓流离失所。
其实，这连续所有的命案都是神秘国师在暗中操纵，萨摩多罗查案竟也成为他的复国工具。国师从黄泥潭救出波斯人和赵匡国，为他们制定复仇计划，目标就是兵部侍郎杜梁园，因为杜梁园是朝中最熟悉西线边防的将军，只有他死了，大唐西线才会羸弱，给了国师军队长驱直入的可能。杜梁园死后，国师安排心腹顶替兵部侍郎职位，遭到吏部尚书的阻挠，随后，大理寺开始调查灵猫杀人案，国师派人杀了雪儿，故意把线索引向刘尚书。圣恩寺的僧人都是隋朝投诚的老臣，国师故意挑拨，让李世民对其心生疑虑，派大理寺调查。苏秀才休妻，国师诱导其妻子赵思楠毒杀丈夫，赵思楠伏法后，其父亲赵校尉被牵连，空出了武备库的职位，武备库也落入国师之手，走私军械也是从此开始。杜老太太与僧人合谋杀人，也是国师的诱导，目的是谋取杜老太在长安西南的三千亩山地，成了国师的驻军点。神偷刘方也是国师的线人，古饰杀人、刘员外儿子惨死、善于治疗天花的邓维杀人，也是国师的阴谋，都是为了控制大唐的战马供给，清除一切能臣智者，便于掏空大唐内部。
没想到，这二十多起案件，都是神秘国师一手所为，看似单独案件，实际却都有牵绊，而萨摩多罗屡屡破案，擒拿凶手，却正中了国师的陷阱，为国师清除了障碍。