珍爱榕之情感动了青，青不再执着，将药方交出，并穿针引线，叫藏收珍为徒。青与珍从此以师兄妹相称。榕病愈后，娇没有让她打理家务，榕无所事事，找喜教授自己厨艺。疫症爆发，村民争相购药。珍要求荆王和林知县拨款来赠医施药，同时公布疫情。林知县不欲事件给张扬，以免为朝廷怪罪，故不惜牺牲村民的性命来自保，引致疫情一发不可收拾。宪在濒湖实习，他向荆王自荐到惠民药局医治村民。疫情告急，珍在城门外设置临时检疫站；村民争相检疫，引发集体殴斗。宪见珍对抗疫的热诚，愿协助珍与村民共渡难关；珍成为抗疫英雄。

珍将染病的村民集中在山上医治，青、闻等共同协助。抗疫期间，青与珍共同研究药方，二人志同道合，青对珍的爱火重燃。榕弄来美食慰劳各人，娇才发现她秘密学习厨艺。宪向高官筹款，将款项用作购买名贵药材给病人调理身体，珍感激。珍从藏身上得到启发，研制出蒸醋消毒法。无良J商售卖假药，珍将他们逐一驱赶。病人得到珍及青等的治理后渐渐康复。珍操劳过度，染上疫症。榕得知珍染病，担心不已。藏发现田鼠有治疗瘟疫的疗效，遂提出以田鼠医治病人；宪反对没有理据的方法，惟青却赞成一试。

珍研制鼠药汤，并以身试药，希望其他人会顺服它的疗效。珍的病情恶化，他在病榻中向青表白心迹，青虽感动却不敢接受。鼠药汤终发挥疗效，珍病情好转。抗疫成功，林知县邀功，遭村民谴责。宪为助林知县挽回民心，提出向朝廷拨款捐助受害人家属。珍眼见疲症期间官方药局抓错药，加上J商售卖假药，决定重修历代本草纲目，让世人辨别真伪。珍向荆王要求支助重修本草纲目，荆王见花费庞大而拒绝。珍希望借助太医院的力量来达成心愿，宪愿协助他将大纲上奏朝廷。荆王的堂兄楚王携孙儿恒拜访荆王府，榕与珍往拜会。珍治好了恒的怪病，获楚王赏赐。